Епидемија на ротавирус од група Ц во основно училиште во Лужоу, Кина, и технологијата за секвенционирање на целиот геном на „Макроа и микро-тест“ овозможува прецизно следење на изворот

Неодамна,Неделник на ЦДЦ во Кинаобјавија важен истражувачки напис во кој се опишува епидемиолошкото и етиолошкото истражување на епидемија на акутен гастроентеритис предизвикана од ротавирус од група Ц (RVC) во основно училиште во Лужоу, покраина Сечуан, во октомври 2025 година. Имено, комплетот за фаќање на целни патогени со висок проток (фаќање со сонда) и технологијата за збогатување на секвенционирање на целиот геном на Macro & Micro-Test одиграа клучна улога во истражувањето. Со овозможување на прецизна идентификација на патогени и сеопфатна геномска карактеризација, технологијата обезбеди критични научни докази за брза потврда на епидемијата, прецизно следење на изворот и ефикасна контрола на епидемијата.

Макро микро тест

Ненадејна епидемија: Прва пријавена епидемија на RVC во југозападна Кина

На 15 октомври 2025 година, во основно училиште во Лужоу се случи епидемија на акутен гастроентеритис. Училиштето имаше вкупно 1.943 ученици и персонал, со пријавени 32 случаи, вклучувајќи 6 лабораториски потврдени и 26 клинички дијагностицирани случаи, што резултираше со вкупна стапка на напад од 1,65%. Епидемијата достигна врв помеѓу 15 и 16 октомври, при што 7-мо одделение, 5-то одделение доживеа највисока стапка на напад (23,08%). Повеќето пациенти беа деца на училишна возраст (средна возраст: 10 години), кои се јавуваа првенствено со повраќање (65,62%), дијареја (46,87%) и болки во стомакот (37,50%). Симптомите обично траеја 1-3 дена, а сите пациенти се опоравија без тешки компликации.

Прв пријавен RVC

Епидемиолошката истрага го идентификуваше индексниот случај како 11-годишно момче во 7-мо одделение, 5-то одделение. Неговата помлада сестра развила слични симптоми пред него, што укажува на пренос во домаќинството како почетен извор. Несоодветното справување со повраќањето на кампусот - вклучително и директно метење и отстранување без навремена дезинфекција или изолација на просторот - во комбинација со лошата хигиена на рацете кај учениците, веројатно го олесни понатамошното пренесување. Повеќето засегнати училници се наоѓаа помеѓу вториот и петтиот кат и споделуваа соседни машки тоалети, што укажува дека и аеросолниот и контактниот пренос можеби придонеле за ширењето.

Истрагата стана особено предизвикувачка бидејќи рутинското скрининг на патогени, вклучувајќи тестови за норовирус и ротавирус од група А, даде негативни резултати, што укажува дека е одговорен невообичаен патоген.

Етиолошка дијагноза: Секвенционирањето на целиот геном со макро и микро-тест го идентификува виновникот

Првичното тестирање за норовирус беше негативно. Центарот за контрола и превенција на болести во Лужоу потоа употреби мултиплекс PCR тест за гастроинтестинални патогени во реално време, способен истовремено да открие 28 патогени, вклучувајќи 8 вируси, 17 бактерии и 3 паразити, за да скринира осум клинички примероци. На 17 октомври, шест примероци беа позитивни на ротавирус од група Ц, успешно идентификувајќи го предизвикувачкиот патоген.

За понатамошно пронаоѓање на изворот на епидемијата, истражувачите извршија и секвенционирање на нанопори на метагеном и секвенционирање збогатено со сонда за снимање на целиот геном на Macro & Micro-Test на пет позитивни примероци. Овој пристап успешно генерираше пет комплетни секвенци на геномот на RVC (SC01–SC05). Интегрираната стратегија за брзо мултиплекс PCR скрининг проследено со секвенционирање на целиот геном со висока резолуција обезбеди робусна техничка поддршка за точна молекуларна епидемиологија и пронаоѓање на изворот.

Научни сознанија: Прва идентификација на генотипот М2 во Југозападна Кина

Врз основа на висококвалитетните податоци за целиот геном генерирани со технологијата на Macro & Micro-Test, истражувачкиот тим објави неколку важни научни наоди:

Потврда за моноклонална епидемија:Сите пет вирусни изолати делеле идентичен генотип на целиот геном (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), со само 0–1 разлики во полиморфизмот на единечен нуклеотид (SNP), што убедливо покажува дека епидемијата потекнува од еден синџир на пренос.

Откривање на генотипот М2:Филогенетската анализа покажа дека соевите на RVC од Лужоу припаѓаат на генотипот M2, а не на генотипот M3, кој претходно се сметаше за доминантен меѓу кинеските соеви на RVC. Ова откритие го оспорува конвенционалното разбирање за дистрибуцијата на генотипот RVC во Кина и ја потврдува појавата на генотипот M2 во југозападна Кина.

Докази за меѓународни преносни врски:Споредбата на целиот геном покажа висока генетска сличност помеѓу соевите Лужоу и соевите на RVC претходно објавени во Јунан (2025), Новосибирск, Русија (2017) и Италија (2012), што укажува на постоење на активна евроазиска преносна мрежа.

 

Докази за меѓународни преносни врски

Импликации за превенција и контрола: Раното откривање и брзата интервенција се од суштинско значење

По идентификацијата на патогенот, Центарот за контрола и превенција на болести во Лужоу веднаш спроведе сеопфатни контролни мерки, вклучувајќи изолација на случајот, дезинфекција на животната средина, стандардизирано управување со повраќањето и привремено суспендирање на класата. Епидемијата беше успешно контролирана во еден период на инкубација, без пријавени дополнителни случаи по 21 октомври.

Истрагата, исто така, дава важна лекција за јавното здравје: за епидемии на кластерски гастроентеритис кои се негативни и за ротавирус од група А и за норовирус, ротавирусот од група Ц и другите ротавируси кои не се од група А треба да се вклучат во рутинскиот дијагностички скрининг.

Оваа студија претставува прва пријавена епидемија на ротавирус од група Ц во југозападна Кина и прва идентификација на генотипот М2 во регионот, проширувајќи го сегашното разбирање на епидемиологијата на RVC во Источна Азија. Во ова истражување, интегрираното решение на Macro & Micro-Test, кое комбинира мултиплекс PCR скрининг со секвенционирање со збогатување на целиот геном, покажа значајна практична вредност со тоа што овозможи брза идентификација на патогени и следење на молекуларните извори со висока резолуција, обезбедувајќи репродуцирана техничка рамка за прецизно истражување и контрола на идните епидемии на заразни болести.

 


Време на објавување: 30 јули 2026 година