Неодамнешна студија објавена воМикробиомспроведе вирусна метагеномска анализа на 846 диви мали цицачи - вклучувајќи лилјаци, глодари и врчви - собрани во Сиера Леоне, Западна Африка. Студијата идентификуваше вкупно 39 РНК вируси поврзани со цицачи, кои опфаќаат 26 нови и 13 претходно познати вируси. Меѓу нив, семејството Paramyxoviridae покажа најголема разновидност, додека глодарите имаа најголем број вирусни видови (n = 26).
Проценката на зоонотичниот ризик откри три познати зоонотични вируси - вирус на енцефаломиокардитис, вирус Ласа и Rocahepevirus sp. - како и три вируси со потенцијален ризик од прелевање: Melian вирус, вирус на глодарски хепатитис и Hunnivirus A. Имено, меѓу новоидентификуваните вируси, Bat ledantevirus 2 покажа најблизок филогенетски однос со вирусот Le Dantec што го инфицира човекот. Серолошката анализа дополнително откри неутрализирачки антитела против овој вирус кај 2,8% од локалните жители, што укажува на претходна, веројатно неоткриена, изложеност на луѓе.
Овие наоди го истакнуваат присуството на значителен резервоар на вируси доминиран од глодари во Западна Африка и ја нагласуваат критичната важност на интегрираните стратегии за надзор на интерфејсот човек-животина. Комбинирањето на метагеномскиот скрининг со серолошката валидација обезбедува робусна рамка за идентификување на вируси со зоонозен потенцијал и потенцијал за прелевање.
Во текот на изминатата деценија, повеќе од 60% од новите заразни болести кај луѓето потекнуваат од животински резервоари, при што лилјаците, глодарите и врчвите се препознаваат како клучни домаќини на зоонотични вируси. Африка е широко сметана за жариште на зоонотични болести. На пример, Сиера Леоне пријави над 28.000 случаи за време на епидемијата на ебола во периодот 2014-2016 година.
И покрај значителниот товар на зоонотски заболувања во овој регион, разновидноста и дистрибуцијата на вирусите кај дивите мали цицачи остануваат недоволно карактеризирани. За да се надмине овој јаз, истражувачите спроведоа систематска анализа на вироми на 846 диви мали цицачи заробени на три локации во Сиера Леоне помеѓу 2018 и 2023 година. Студијата имаше за цел да ја карактеризира вирусната разновидност, да идентификува кандидати со потенцијал за пренос меѓу видовите, да го процени зоонотскиот ризик и да генерира докази за поддршка на системите за рано предупредување за нови заразни болести.
Основни методи
Студијата примени сеопфатен работен тек на вирусна метагеномика:
- Обработка на примероци:Ткивата од срце, црн дроб, слезина, бели дробови и бубрези беа собрани, споени, хомогенизирани и подложени на екстракција на целосна РНК.
- Секвенционирање и склопување:Пред изградбата на библиотеката беше извршено намалување на рибозомската РНК, по што следеше секвенционирање со висок проток со користење на платформата Illumina NovaSeq 6000. Вирусните контизи беа составени de novo.
- Идентификација на вирусот:Вирусите беа идентификувани врз основа на усогласување на гените на РНК-зависната РНК полимераза (RdRp). Задржани беа само вируси поврзани со 'рбетници, со исклучок на бактериски, габични и растителни вируси.
- Биоинформатичка анализа:Беа спроведени филогенетска реконструкција, анализа на рекомбинација, моделирање на мрежата за пренос меѓу видовите и проценка на зоонотичниот ризик.
- Серолошка валидација:Развиен е тест за неутрализација на псевдовирус базиран на VSV за Bat ledantevirus 2. Неутрализирачки антитела се откриени во 2,8% од човечките серуми, што обезбедува докази за потенцијален зоонозен пренос.
СтудијаРезултати
1. Вирално откривање и разновидност
Оваа студија спроведе транскриптомска анализа на секвенционирање на 846 диви животни собрани во Сиера Леоне, вклучувајќи глодари, лилјаци и врчви. Врз основа на комплетни секвенци на генот на РНК-зависна РНК полимераза (RdRp), идентификувани се вкупно 39 РНК вируси поврзани со цицачи, вклучувајќи 13 претходно познати вируси и 26 нови вируси.
Во однос на вирусниот состав, семејството Paramyxoviridae покажа највисоко ниво на разновидност во сите три реда домаќини, по што следат Astroviridae и Picornaviridae. Во однос на дистрибуцијата на домаќини, глодарите придонесоа за најголема вирусна разновидност, засолнувајќи вкупно 26 видови вируси, што укажува на нивната истакната улога како резервоари на вирусна разновидност во регионот.
2. Зоонозен ризик
Проценката на зоонотичниот ризик идентификуваше три познати зоонотични вируси: вирус на енцефаломиокардитис, вирус Ласа и видови на Рокахепевирус. Покрај тоа, три вируси - Мелијан вирус, вирус на глодарски хепатитис и Хунивирус А - беа идентификувани како вируси со потенцијален ризик од прелевање.
Меѓу 26-те новооткриени вируси, за четири се предвидуваше дека поседуваат висок зоонотски потенцијал врз основа на филогенетските и геномските карактеристики. Имено, вирусот Bat ledante 2 покажа најблизок филогенетски однос со познатиот вирус Le Dantec што ги инфицира луѓето.
Последователните серолошки истражувања дополнително го потврдија ова откритие, бидејќи неутрализирачки антитела против вирусот Bat ledante 2 беа откриени кај 2,8% од серумите од локалните жители. Овој резултат сугерира дека непрепознаени или асимптоматски инфекции можеби веќе се појавиле кај човечката популација, истакнувајќи потенцијален, но претходно неоткриен зоонозен пат на пренос.
3. Динамика на пренесување меѓу видовите
Анализата на преносот меѓу видовите покажа дека глодарите заземаат централна позиција во мрежата за споделување на вируси, дејствувајќи како клучни јазли што ја олеснуваат размената на вируси помеѓу видовите домаќини. Вкупно 15 вируси беа идентификувани како вируси со потенцијал за пренос меѓу видовите.
Понатамошната анализа на моделите на пренос во вкрстен ред покажа дека споделувањето на вирусот се случува почесто меѓу домаќините во истиот таксономски ред, што укажува дека поврзаноста на домаќинот игра важна улога во динамиката на пренос. Спротивно на тоа, лилјаците покажаа релативно помал капацитет за пренос во вкрстен ред.
Важно е да се напомене дека кај одредени вируси се забележани докази за проширување на опсегот на домаќини. На пример, мелианскиот вирус, кој претходно се сметаше за специфичен за вртиците, беше откриен и кај глодари во оваа студија, што укажува на потенцијална промена во прилагодливоста на домаќинот и зголемен ризик од поширок пренос.
Заклучоци и импликации за јавното здравје
- Висока разновидност на вироми кај дивите мали цицачи:Откривањето на 39 РНК вируси, вклучувајќи 26 нови видови, открива голем резервоар на вируси во регионот и за прв пат известува за нови вируси со висок зоонозен потенцијал (на пр., Bat ledantevirus 2).
- Глодари како приоритетни цели за надзор:Глодарите дејствуваат како клучни центри за пренос на вирусот и носат најголема вирусна разновидност, што претставува најголем ризик од прелевање.
- Потреба од интегрирани стратегии за надзор:Наодите ја поддржуваат распределбата на глодарите во програмите за активен надзор и имплементацијата на интегрирани пристапи што комбинираат метагеномика, серологија и еколошки мониторинг на интерфејсите меѓу човекот и дивиот свет.
Генерално, оваа студија обезбедува критични докази за поддршка на системите за рано предупредување и рамките за проценка на ризикот за новите зоонотски болести, зајакнувајќи ја важноста на проактивниот надзор во регионите со висок ризик.
Информации за производот
Време на објавување: 23 март 2026 година