Прекинување на ТБ и ДР -ТБ Дијагностички раствор од #macro & micro -test!

Ново оружје за дијагностицирање на туберкулоза и откривање на отпорност на лекови: Нова генерација насочена кон секвенционирање (TNGS) во комбинација со машинско учење за дијагностицирање на хиперсензитивност на туберкулоза

Извештај за литература: ЦЦА: Дијагностички модел заснован на TNGS и машинско учење, кој е погоден за луѓе со помалку бактериска туберкулоза и туберкулозен менингитис.

Наслов на тезата: Tuberculous секвенционирање на следната генерација и учење на машината: Ултра чувствителна стратегија за дијагностицирање за пауцифични пулмонални тубулари и тубуларен менингитис.

Периодично: 《Клиника Чимика Акта

Ако 6,5 фунти

Датум на објавување: јануари 2024 година

Во комбинација со Универзитетот на кинеска академија на науки и во Пекинг во болницата за градите на капиталниот медицински универзитет, Макро и микро-тест воспоставија модел за дијагностицирање на туберкулоза, заснован на новата генерација на насочена технологија за секвенционирање (TNGS) и метод за учење на машини, што обезбеди ултра-високо-високо Детекција чувствителност за туберкулоза со неколку бактерии и туберкулозен менингитис, обезбеди нов метод за дијагностицирање на хиперсензитивност за клиничка дијагноза на две Видови на туберкулоза и помогнаа на точна дијагноза, откривање на отпорност на лекови и третман на туберкулоза. Во исто време, откриено е дека плазмата на пациентот cfDNA може да се користи како соодветен тип на примерок за клиничко земање мостри во дијагнозата на ТБМ.

Во оваа студија, беа користени 227 примероци од плазма и примероци од цереброспинална течност за да се воспостават две клинички групи, во кои лабораториските дијагностички примероци од групата беа користени за да се воспостави модел на машинско учење на дијагностицирање на туберкулоза, а примероците од клиничка дијагностика беа користени за да се провери утврдениот Дијагностички модел. Сите примероци за прв пат беа насочени кон специјално дизајниран базен за сонда за фаќање за фаќање за Mycobacterium tuberculosis. Потоа, врз основа на податоците за секвенционирање на TB-TNGS, моделот на дрво на одлуки се користи за извршување на 5-пати вкрстена валидација на сетови за обука и валидација на лабораториската редица за дијагностицирање и се добиваат дијагностички прагови на примероци од плазма и примероци од цереброспинална течност. Добиениот праг се внесува во две тест групи на редица за клиничка дијагностика за откривање, а дијагностичката изведба на ученикот се оценува со кривата ROC. Конечно, добиен е моделот за дијагностицирање на туберкулоза.

Сл. 1 Шематски дијаграм на дизајн на истражување

Резултати: Според специфичните прагови на примерокот CSF DNA (AUC = 0,974) и примерокот на плазма cfDNA (AUC = 0,908) утврдени во оваа студија, меѓу 227 примероци, чувствителноста на примерокот CSF беше 97,01%, специфичноста беше 95,65%и Чувствителноста и специфичноста на примерокот во плазмата беа 82,61% и 86,36%. Во анализата на 44 спарени примероци на плазма cfDNA и цереброспинална течност ДНК од пациенти со ТБМ, дијагностичката стратегија на оваа студија има висока конзистентност од 90,91% (40/44) во ДНК во плазма cfDNA и цереброспинална течност, а чувствителноста е 95,45% (42/44). Кај деца со белодробна туберкулоза, дијагностичката стратегија на оваа студија е почувствителна на примероците од плазма од резултатите од откривањето на Xpert на примероците од сок од желудник од истите пациенти (28,57% наспроти 15,38%).

Сл. 2 Анализа на перформансите на моделот за дијагностицирање на туберкулоза за примероци од население

Сл. 3 Дијагностички резултати на спарени примероци

Заклучок: Во оваа студија е утврден хиперсензитивен дијагностички метод за туберкулоза, која може да обезбеди дијагностичка алатка со најголема чувствителност на откривање кај клинички пациенти со олигобациларна туберкулоза (негативна култура). Откривање на хиперсензитивна туберкулоза заснована врз плазма cfDNA може да биде соодветен тип на примерок за дијагностицирање на активна туберкулоза и туберкулозен менингитис (примероците од плазма се полесно да се соберат отколку цереброспиналната течност за пациенти осомничени за туберкулоза на мозокот).

Оригинална врска: https://www.scienceirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? преку%3dihub

Кратко воведување на производи за откривање на серија за макро и микро-тест туберкулоза

Со оглед на комплицираната состојба на примерокот на пациенти со туберкулоза и разни потреби, макро и микро-тест обезбедува целосен сет на NGS решенија за екстракција на ликвидација од примероци од спутум, градежништво и секвенционирање на библиотеката Qualcomm и анализа на податоци. Производите опфаќаат брза дијагноза на пациенти со туберкулоза, откривање на отпорност на лекови на туберкулоза, пишување на микобактериум туберкулоза и НТМ, дијагноза на хиперсензитивност на бактерии-негативни туберкулоза и туберкулозни луѓе, итн.

Комплети за сериско откривање за туберкулоза и микобактерии:

Точка бр Име на производот Содржина за тестирање на производи Тип на примерок применлив модел
HWTS-3012 Агент за ослободување на примерокот Користено во третманот со ликвидација на примероците од спутум, има добиено рекорден број од прва класа, опрема за машини Сутонг 20230047. спутум
HWTS-NGS-P00021 Комплет за откривање количина на Qualcomm за хиперсензитивна туберкулоза (метод за фаќање на сондата) Неинвазивно откривање на хиперсензитивност на (течна биопсија) за бактерии-негативни белодробни туберкулоза и мозочни нодули; Примероците на луѓе за кои се сомневаат дека се заразени со туберкулоза или не-туберкулоза микобактерии биле анализирани со метагеномика на секвенционирање со голема длабочина, а информациите за откривање за тоа дали микобактериите за туберкулоза или не-туберкулоза биле заразени и главната информација за отпорност на лекови од прва линија на микобактериум ТУБЕРКУС беа обезбедени. Периферна крв, алвеоларна лаважа течност, хидроторакс и асцити, примерок од пункција на фокусот, цереброспинална течност. Втора генерација
HWTS-NGS-T001 Комплет за пишување Mycobacterium и комплет за откривање на отпорност на лекови (метод за секвенционирање на мултиплекс засилување) Тест за пишување Mycobacterium, вклучувајќи MTBC и 187 NTMОткривање на отпорност на лекови на микобактериум туберкулоза опфаќа 13 лекови и 16 основни места за мутација на гените на отпорност на лекови. Спутум, алвеоларна лаважа течност, хидроторакс и асцити, примерок од пункција на фокусот, цереброспинална течност. Двојна платформа од втора/трета генерација

Определување: HWTS-NGS-T001 Микобактериум пишување и комплет за откривање на отпорност на лекови (метод на мултиплекс засилување)

Вовед во производ

Производот се заснова на главните лекови од прва и втора линија опишани во упатствата за третман на СЗО, макролиди и аминогликозиди кои најчесто се користат во упатствата за третман на НТМ, а местата за отпорност на лекови ги опфаќаат сите една група на места поврзани со отпорност на лекови во Комплекс на мутација на комплексот мутација на микобактериум туберкулоза, како и други пријавени гени на отпорност на лекови и места за мутација според истрагата и статистиката на Литератури со високи оценки дома и во странство.

Идентификацијата за пишување се заснова на видовите на NTM сумирани во упатствата за НТМ објавени од кинескиот журнал за туберкулоза и респираторни заболувања и консензус на експерти. Дизајнираните буквари за пишување можат да ги засилат, секвенцата и анотираат повеќе од 190 ntm видови.

Преку насочена технологија за засилување на мултиплекс PCR, генотипирањето гени и гените отпорни на лекови на Mycobacterium беа засилени со мултиплекс PCR, а беше добиена и комбинацијата на ампликон на целните гени. Засилените производи можат да бидат конструирани во библиотеки со висока секвенца од втора генерација или трета генерација, и сите платформи за секвенционирање на втора генерација и трета генерација можат да бидат подложени на секвенционирање на високи длабочини за да се добијат информациите за секвенцата на целните гени. Со споредување со познатите мутации содржани во вградената референтна база на податоци (вклучувајќи ја и каталогот на комплексот мутација на Mycobacterium tuberculosis и неговата врска со отпорност на лекови), беа утврдени мутациите поврзани со отпорност на лекови или подложност на лекови против туберкулоза. Во комбинација со само-отворениот раствор за третман на примерок од спутум на макро и микро-тест, проблемот со ниска ефикасност на засилување на нуклеинска киселина на клинички примероци од спутум (десет пати поголема од онаа на традиционалните методи) беше решено, така што може да биде откривање на секвенционирање на отпорност на лекови може да биде директно се применува на клинички примероци на спутум.

Опсег на откривање на производи

34гени поврзани со отпорност на лекови од18лекови против туберкулоза и6Откриени се лекови за НТМ, покривајќи297места за отпорност на лекови; Десет видови на микобактериум туберкулоза и повеќе од190Откриени се видови на НТМ.

Табела 1: Информации за 18+6 лекови+190+ntm

Предност на производот

Силна клиничка прилагодливост: примероците од спутум можат директно да се откриат со агент за само-ликвидација без култура.

Експерименталната операција е едноставна: Првиот круг на операција за засилување е едноставна, а градежништвото на библиотеката е завршена за 3 часа, што ја подобрува ефикасноста на работната работа.

Сеопфатно пишување и отпорност на лекови: Покривање на местата за пишување и отпорност на лекови на MTB и NTM, кои се клучни точки на клиничка загриженост, точно пишување и откривање на отпорност на лекови, поддршка на независен софтвер за анализа и генерирање извештаи за анализа со еден клик.

Компатибилност: Компатибилност на производот, прилагодување на мејнстрим платформите ILM и MGI/ONT.

Спецификација на производот

Код на производот Име на производот Платформа за откривање спецификации
HWTS-NGS-T001 Комплет за пишување Mycobacterium и комплет за откривање на отпорност на лекови (метод на мултиплекс засилување) Ont 、 Illumina 、 mgi 、 Salus Pro 16/96RXN

Време на објавување: Јан-23-2024